故事开始,就是介绍 the matrix。平凡的尼奥被墨菲斯从培养皿中,救走并被告知他自己活在虚拟世界,通过脑后的接口连入母体,母体是机器人创造的世界。机器在与人类大战,人类遮蔽了天空,是为了断绝机器人的太阳能供应。但是人类失败了,机器把人禁锢在一望无尽的容器内,以种植的方式培养。在墨菲斯看来,机器把人种植在容器里是为了获取稳定的生物电,母体的存在是为了禁锢住活在容器中人的思维,从而保持身体恒定,能提供稳定的能源,代替太阳能。尼奥进入母体世界,被墨菲斯与先知告知自己是母体中的the one,并且在与维持母体内部稳定安全的斯密斯特工(是母体的安全程序。类似杀毒软件)大战中死而复生,尼奥相信自己是救世主的事实。第一部的意义,在于探讨虚拟与真实的区别,千百年来哲学与自然的难题,涉及各种宗教的世界观,并且具有极强的人文情怀。第一部在科幻电影史上是具有里程碑意义的,把商业电影上升到哲学的